Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav4-2A0A075B638 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Trav4-2A0A075B638 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trav4-2A0A075B638 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trav4-2A0A075B638 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trav4-2A0A075B638 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trav4-2A0A075B638 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trav4-2A0A075B638 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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