Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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SS18Q15532 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SS18Q15532 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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SS18Q15532 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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SS18Q15532 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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SS18Q15532 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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SS18Q15532 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
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SS18Q15532 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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SS18Q15532 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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