Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CUL4AQ13619 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms