Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NDUFB4-201ENST00000184266 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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