Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXF1Q12946 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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