Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC068790.1-201ENST00000536166 355 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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UBXN4Q92575 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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UBXN4Q92575 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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UBXN4Q92575 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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UBXN4Q92575 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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UBXN4Q92575 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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UBXN4Q92575 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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UBXN4Q92575 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 MRPL49P1-201ENST00000505951 535 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
UBXN4Q92575 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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