Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC108477.1-201ENST00000636764 526 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.212-201ENST00000636778 248 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 C15orf41-214ENST00000569302 1325 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 HBS1L-202ENST00000367820 638 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TSACC-202ENST00000368252 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC133644.1-201ENST00000398171 937 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RN7SKP194-201ENST00000411328 351 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 P2RX6P-201ENST00000439119 468 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TTN-AS1-218ENST00000586452 828 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AF146191.1-201ENST00000604941 889 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC005790.1-201ENST00000619774 450 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 FAAHP1-207ENST00000635606 398 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 GNPAT-201ENST00000366647 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 C12orf45-201ENST00000280749 459 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms