Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CARD17-201ENST00000375707 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC073842.1-201ENST00000376482 342 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 IGHVIII-67-3-201ENST00000517650 232 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 FBXO36-202ENST00000373652 3120 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL049651.2-202ENST00000419734 412 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL161729.2-201ENST00000605700 456 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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