Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ALCAMQ13740 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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