Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
LMAN2Q12907 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
LMAN2Q12907 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms