Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC008938.1-201ENST00000566929 6510 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PAICS-207ENST00000512576 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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BPTFQ12830 DRP2-203ENST00000402866 7018 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 MR1-205ENST00000434571 7479 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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