Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
HOXA13P31271 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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HOXA13P31271 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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HOXA13P31271 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXA13P31271 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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