Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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