Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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