Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC005899.3-201ENST00000580360 271 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms