Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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BRD3Q15059 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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BRD3Q15059 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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BRD3Q15059 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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BRD3Q15059 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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BRD3Q15059 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
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BRD3Q15059 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC01146-206ENST00000556684 361 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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