Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
GRIK2Q13002 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms