Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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BNIP1Q12981 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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BNIP1Q12981 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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BNIP1Q12981 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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BNIP1Q12981 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BNIP1Q12981 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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