Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPN11Q06124 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms