Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CLDN9O95484 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CLDN9O95484 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN9O95484 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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