Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DUX4L9Q6RFH8 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms