Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
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CNGB1Q14028 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC8.31□□□□□ -1.08
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CNGB1Q14028 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
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CNGB1Q14028 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
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CNGB1Q14028 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
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CNGB1Q14028 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
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CNGB1Q14028 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
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CNGB1Q14028 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
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CNGB1Q14028 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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CNGB1Q14028 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
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CNGB1Q14028 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
CNGB1Q14028 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
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