Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 LINC00678-202ENST00000534757 798 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 STARD13-AS-224ENST00000608496 787 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 uc_338.33-201ENST00000614988 170 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC244196.5-201ENST00000617347 406 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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