Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
DUSP4Q13115 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms