Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 LINC01284-201ENST00000442994 730 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 RN7SL798P-201ENST00000468562 301 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 DCSTAMP-203ENST00000517991 949 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC100854.1-201ENST00000520351 341 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 STARD13-AS-247ENST00000610879 779 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC119674.1-209ENST00000642031 997 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 ZNF655-222ENST00000493277 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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LINC00587B1AMM8 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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LINC00587B1AMM8 BTF3-201ENST00000335895 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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LINC00587B1AMM8 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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LINC00587B1AMM8 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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LINC00587B1AMM8 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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LINC00587B1AMM8 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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LINC00587B1AMM8 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 ETFRF1-210ENST00000556927 833 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 MIR6754-201ENST00000621121 66 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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