Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
LETM2Q2VYF4 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
LETM2Q2VYF4 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms