Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SMIM12-201ENST00000417239 684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AP003499.1-201ENST00000527217 574 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 OR7E1P-201ENST00000533891 958 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC02284-201ENST00000558120 573 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF286A-214ENST00000581529 560 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL513523.1-201ENST00000417868 1309 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 FGL1-203ENST00000398054 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms