Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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FOXD4Q12950 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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FOXD4Q12950 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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FOXD4Q12950 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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FOXD4Q12950 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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FOXD4Q12950 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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FOXD4Q12950 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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FOXD4Q12950 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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FOXD4Q12950 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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