Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SREBF2Q12772 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SREBF2Q12772 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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