Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXC13P31276 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms