Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TSPOP30536 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TSPOP30536 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms