Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
COPS7AQ9UBW8 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COPS7AQ9UBW8 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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