Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms