Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RNU1-38P-201ENST00000362817 144 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC012560.1-202ENST00000421324 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RPL5P27-201ENST00000437011 881 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC097375.1-201ENST00000507949 488 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC091178.1-204ENST00000577328 366 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC008734.1-201ENST00000594006 537 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC023310.4-201ENST00000613130 650 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
UBXN4Q92575 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.1 ms