Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SIX1Q15475 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms