Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TTPAP49638 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TTPAP49638 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TTPAP49638 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TTPAP49638 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TTPAP49638 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TTPAP49638 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TTPAP49638 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TTPAP49638 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TTPAP49638 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TTPAP49638 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TTPAP49638 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TTPAP49638 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TTPAP49638 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TTPAP49638 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.6 ms