Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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HOXD12P35452 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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