Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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PTPRAP18433 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
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PTPRAP18433 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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PTPRAP18433 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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PTPRAP18433 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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PTPRAP18433 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRAP18433 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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