Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms