Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms