Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CLDN19Q8N6F1 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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