Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PGGT1BP53609 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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PGGT1BP53609 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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PGGT1BP53609 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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PGGT1BP53609 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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PGGT1BP53609 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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