Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 GNRH1-201ENST00000276414 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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LINC00587B1AMM8 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 RNU1-38P-201ENST00000362817 144 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 RNA5SP71-201ENST00000362967 126 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 VN1R33P-201ENST00000411800 887 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 SOX9-AS1-203ENST00000424417 576 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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LINC00587B1AMM8 Z99758.1-201ENST00000432081 368 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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LINC00587B1AMM8 AL023584.1-201ENST00000437067 349 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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LINC00587B1AMM8 AC007879.2-201ENST00000454444 551 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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LINC00587B1AMM8 NPIPA5-203ENST00000543801 699 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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LINC00587B1AMM8 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 Metazoa_SRP.39-201ENST00000614194 271 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 MIR6880-201ENST00000622851 62 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 AC073862.2-201ENST00000625114 701 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 FLII-230ENST00000628188 156 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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LINC00587B1AMM8 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 GCSAML-204ENST00000463359 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
LINC00587B1AMM8 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 LINC01392-201ENST00000419883 565 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
LINC00587B1AMM8 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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