Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL138807.1-201ENST00000400354 459 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL161787.1-201ENST00000401543 174 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL604028.1-201ENST00000430643 598 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 PRSS48-201ENST00000441586 560 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AP002856.4-201ENST00000441638 569 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL021939.1-201ENST00000441868 886 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL272P-201ENST00000487762 289 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 C4orf19-203ENST00000508175 828 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 GZMB-205ENST00000526004 819 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AP000893.2-201ENST00000527550 433 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC090707.1-201ENST00000528795 396 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC044839.1-209ENST00000529769 878 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 MS4A12-205ENST00000537076 1019 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 LINC02289-202ENST00000556781 861 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 MIR4793-201ENST00000577502 87 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AP001025.3-201ENST00000578787 864 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC123788.2-201ENST00000612290 283 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL113P-201ENST00000619959 299 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 STK32A-209ENST00000626951 798 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC103760.1-201ENST00000521326 1486 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 GZMA-201ENST00000274306 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL450124.1-201ENST00000376401 353 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC004160.2-201ENST00000425837 563 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 HMGA1P4-201ENST00000428643 334 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL022721.1-201ENST00000436521 505 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC016734.1-201ENST00000436998 654 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC074257.1-201ENST00000446340 585 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL391361.2-202ENST00000454826 439 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 ABRACL-202ENST00000461027 456 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC034232.2-201ENST00000511579 917 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC233290.2-201ENST00000552852 390 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CSPP1Q1MSJ5 FDPSP3-201ENST00000556903 1013 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms