Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 GRM7-AS2-201ENST00000427748 520 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RPL5P3-201ENST00000493817 889 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC025188.1-201ENST00000507514 600 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 DCN-215ENST00000550099 719 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SMCO1Q147U7 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SMCO1Q147U7 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms