Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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CUL1Q13616 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CUL1Q13616 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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