Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 TBX18-AS1-201ENST00000423086 421 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 VDAC2P2-201ENST00000544463 901 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RPL6P24-201ENST00000445338 864 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 LINC01961-201ENST00000449954 745 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC024614.1-201ENST00000577546 307 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BNIP1Q12981 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms