Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms