Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 S100Z-201ENST00000317593 1468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CCR3-202ENST00000395940 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC01392-201ENST00000419883 565 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
UBXN4Q92575 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms