Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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